Vogels
De Waddenzee is een belangrijk getijdengebied voor miljoenen vogels die er broeden of er de winter doorbrengen. Bovendien maakt een groot aantal vogels in het Waddengebied een noodzakelijke tussenstop om bij te tanken tijdens de lange trekvluchten van en naar de overwinteringgebieden in West-Afrika en de Arctische broedgebieden tussen Noord-Canada en Siberië.
Broedvogels
Tot de broedvogels van het wadden-gebied horen: meeuwen, sternen, eenden, steltlopers, lepelaars en veel soorten zangvogels. Veel van deze broedvogels trekken bij het aanbreken van de winter terug naar het zuiden. De jaarlijkse tellingen van koloniebroedvoegels, in het kader van het trilaterale monitoringprogramma TMAP, worden georganiseerd door Sovon vogelonderzoek Nederland. De belangrijkste broedgebieden zijn gesloten voor publiek gedurende de broedtijd, die meestal duurt van 15 maart tot 15 augustus.